Investigador principal: José Luis Micol
Investigadora: María Rosa Ponce
Instituto de Bioingeniería. Universidad Miguel Hernández.

Formación en técnicas relacionadas con la secuenciación masiva y la cartografía mediante secuenciación

Los técnicos a contratar dedicarán buena parte de su tiempo a la purificación de ADN a partir de las muestras remitidas por los usuarios fragmentación de muestras de ADN genómico en un sonicador, la incorporación de adaptadores a los extremos de los fragmentos así obtenidos, la amplificación clonal de estos últimos mediante PCR en emulsión sobre microesferas, el enriquecimiento de la muestra en microesferas positivas, la carga de chips de secuenciación con estas últimas, la puesta en marcha de un secuenciador masivo Ion Proton para la obtención de lecturas, el análisis preliminar de estas últimas mediante su alineamiento con una secuencia de referencia, lo que incluirá la estimación de la cobertura obtenida.

En particular, aplicarán las herramientas bioinformáticas desarrolladas por los grupos de José Luis Micol y María Rosa Ponce para analizar decenas o centenares de miles de polimorfimos de un solo nucleótido y realizar con ellos cartografía mediante secuenciación (mapping-by-sequencing), el abordaje experimental más efectivo en nuestros días para identificar los genes causantes de fenotipos mutantes de interés en sistemas modelo animales y vegetales.

Las actividades anteriores se simultanearán con otros aspectos del plan de formación que se detalla en el documento adjunto.